MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017809	TA	4	8	859	866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017809	TAA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017809	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017809	TAG	2	6	898	903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017809	AG	3	6	902	907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017809	CT	3	6	920	925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017809	T	7	7	925	931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017809	T	8	8	950	957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017809	N	969	969	976	1944	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017809	TGA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017809	ACT	2	6	1975	1980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017809	TAA	3	9	2620	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017809	ATA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017809	ATAA	2	8	2654	2661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017809	T	8	8	2703	2710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017809	TAAA	2	8	2718	2725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017809	TATT	2	8	2726	2733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017809	TGT	2	6	2738	2743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017809	ATT	2	6	2756	2761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017809	TTTG	2	8	2764	2771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017809	TTA	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017809	TCA	2	6	3888	3893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017809	GAT	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017809	AT	3	6	3907	3912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017809	TAA	2	6	3926	3931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017809	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017809	AGA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017809	ATTTA	2	10	3997	4006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017809	AT	3	6	4016	4021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017809	TG	3	6	4059	4064	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017809	T	7	7	4065	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017809	T	6	6	4077	4082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017809	TGT	2	6	4094	4099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017809	AGA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017809	A	7	7	4150	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017809	GA	3	6	4164	4169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017809	AAG	2	6	4171	4176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017809	AG	3	6	4175	4180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017809	AAG	2	6	4186	4191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017809	TGA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017809	TAG	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017809	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017809	TA	3	6	5257	5262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017809	AAT	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017809	AAGA	2	8	5277	5284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017809	AAAGG	2	10	5294	5303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017809	TTTTA	2	10	5330	5339	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017809	GT	3	6	5342	5347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017809	TAT	2	6	5383	5388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017809	TAT	2	6	5427	5432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017809	ACAA	2	8	5443	5450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017809	ATT	2	6	5513	5518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017809	AAGG	2	8	5525	5532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.